一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法

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一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法
申请号:CN202410758008
申请日期:2024-06-13
公开号:CN118506921B
公开日期:2024-12-06
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法,包括:通过不同数据库,得到具有特定功效的中药化学成分数据,并获取中药化学成分数据的Canonical SMILES编码;基于ChEMBL数据库,得到具有IC50值的化合物集合并作为背景数据;将中药化学成分数据和化合物集合混合后,计算所有分子的FCFP_6指纹并根据Tanimoto距离进行聚类计算,将结构相似的背景数据和中药化学成分数据划入同一化学空间;构建广义线性模型,基于同一化学空间,通过广义线性模型定量预测中药化学成分的IC50值;将IC50值与已上市药物相比,筛选出开发新药的先导物。本发明能够更准确的定量预测出中药成分的IC50值。
技术关键词
筛选新药 广义线性模型 中药 分子 计算机程序指令 数据 计算机存储介质 聚类 局部敏感哈希 生成树图 指纹 描述符 编码 中医药 布局 软件 有效性 药物 索引 处理器
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