摘要
本发明公开了一种多来源单细胞转录组数据细胞轨迹分析方法,涉及生物信息技术领域。包括以下步骤:S1,对不同来源的单细胞转录组数据进行归一化,筛选高变基因,并通过标准化第一次消除批次效应;S2,合并不同来源的单细胞转录组数据,并基于PCA降维和最大多样性聚类对细胞进行分群,采用CCA算法获得矫正因子矩阵,并使用所述矫正因子矩阵第二次消除批次效应;S3,构建细胞分化轨迹。本发明能降低对单细胞转录组数据的来源一致性要求,允许多种数据来源的单细胞转录组数据共同进行轨迹分析。
技术关键词
单细胞转录组数据
轨迹分析方法
CCA算法
矫正
基因
因子
矩阵
生物信息技术
效应
分群
处理器
指数
计算方法
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