一种多来源单细胞转录组数据细胞轨迹分析方法、介质和设备

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一种多来源单细胞转录组数据细胞轨迹分析方法、介质和设备
申请号:CN202410813745
申请日期:2024-06-24
公开号:CN118380055B
公开日期:2024-09-10
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种多来源单细胞转录组数据细胞轨迹分析方法,涉及生物信息技术领域。包括以下步骤:S1,对不同来源的单细胞转录组数据进行归一化,筛选高变基因,并通过标准化第一次消除批次效应;S2,合并不同来源的单细胞转录组数据,并基于PCA降维和最大多样性聚类对细胞进行分群,采用CCA算法获得矫正因子矩阵,并使用所述矫正因子矩阵第二次消除批次效应;S3,构建细胞分化轨迹。本发明能降低对单细胞转录组数据的来源一致性要求,允许多种数据来源的单细胞转录组数据共同进行轨迹分析。
技术关键词
单细胞转录组数据 轨迹分析方法 CCA算法 矫正 基因 因子 矩阵 生物信息技术 效应 分群 处理器 指数 计算方法 终端设备 存储器 软件 标记 介质 程序
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