混合式筛选食管癌关键基因集及构建其预后模型的方法

本发明提供了一种混合式筛选食管癌关键基因集及构建其预后模型的方法。具体地，从基因表达综合数据库中收集食管癌患者肿瘤样本和正常样本数据，对其进行生物信息学方法和机器学习方法筛选分析，得到和预后相关的关键基因集，通过机器学习方法构建和预后相关的预测诊断模型。步骤包括：收集食管癌肿瘤和正常样本的基因表达矩阵和临床数据文件；进行差异分析和富集分析，初步筛选关键基因；再通过支持向量机递归特征消除(SVM‑RFE)、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)和随机森林(RF)三种机器学习方法进一步筛选食管癌预后相关的关键基因，对结果取交集，获得关键基因集；基于单因素Cox、LASSO回归和多因素Cox回归分析开发食管癌关键基因的预后风险模型。