一种结核分枝杆菌谱系3.1.1 6个新分支鉴定SNP位点的试剂盒及其应用

本发明属于SNP分子标记领域，具体涉及一种用于结核分枝杆菌谱系3.1.1除L3.1.1.i1和L3.1.1.i2两个亚分支外，6个遗传进化分支鉴定的37个SNP位点试剂盒及其应用。目前结核分枝杆菌可进一步的分为具有遗传进化关系的谱系(lineage)1至9，其中较现代的谱系为谱系2,3和4。Maha[1]等基于全基因组数据将谱系3(lineage 3，简称L3)又分为L3.1.1，L3.1.2，L3.2.1和L3.2.2，其中又对L3.1.1进一步分出了L3.1.1.i1和L3.1.1.i2两个亚分支。本专利提供一种对结核分枝杆菌谱系3.1.1除L3.1.1.i1和L3.1.1.i2两个亚分支外的6个新的亚分支深入分型鉴定的方法，以期为致病性基础研究和精准结核病防控提供支持。上述方法涉及包括SNP位点37个的SNP集合，通过该SNP集合能够将结核分枝杆菌谱系3.1.1的6个新亚分支实现鉴定和遗传进化分析，显著提高了SNP在结核分枝杆菌谱系3.1.1的整个8个亚分支中的分辨率和特异性。