一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具

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一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具
申请号:CN202410839795
申请日期:2024-06-26
公开号:CN118841081A
公开日期:2024-10-25
类型:发明专利
摘要
本发明涉及多片段同源重组设计技术领域,具体地说,涉及一种面向多片段同源重组组装设计的自动化在线工具。其包括,用户输入单元接收引物设计参数和设计文件;数据处理单元读取并解析这些文件,提取样本信息和基因序列,检查错误和遗漏;引物设计单元使用Pr imer3和多目标非线性优化算法优化生成引物;重组质粒图谱单元将骨架和外源片段序列拼接成质粒序列,并标记引物;引物订购服务单元整理引物数据,生成合成订购表;发送邮件单元将设计结果和订购信息发送给用户;检查异常信息单元检查系统各阶段的数据,收集并记录异常信息。有益效果:利用多目标非线性优化算法优化引物设计,生成引物序列,提高设计效率和准确性。
技术关键词
非线性优化算法 质粒 异常信息 邮件 PCR引物设计 数据处理单元 参数 图谱 样本 在线 序列验证 基因 校验模块 格式 批量
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