摘要
本发明基于深度因子分解机预测抗癌药物敏感性的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:构建数据集及预处理;步骤2:构建深度因子分解机DeepFM的模型:所述深度因子分解机DeepFM的模型的主要思路是构建因子分解机FM模型、构建深层神经网络模型DNN、将因子分解机FM与深层神经网络相融合构建深度因子分解机DeepFM模型;步骤3:训练各阶段模型结果并评价,将步骤1得到的抗癌药物敏感性数据平均分为5部分,执行5折交叉验证,在此阶段为了训练各个阶段的模型结果。本发明药物低阶特征组合单独建模,并融合高阶特征组合,构建融合深层神经网络模型以及因子分解机模型的模型,更好的提取药物特征结构,使构建模型更准确,精度更高。
技术关键词
Pearson相关系数
抗癌药物
因子
细胞系
DNN模型
深度神经网络
神经网络模型
变量
Sigmoid函数
基因表达数据
多项式
皮尔逊相关系数
随机梯度下降
阶段
参数
线性
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