一种基于细胞死亡模式的癌症分型方法

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一种基于细胞死亡模式的癌症分型方法
申请号:CN202410967190
申请日期:2024-07-18
公开号:CN118969071A
公开日期:2024-11-15
类型:发明专利
摘要
本发明属于医疗数据分析领域,涉及一种基于细胞死亡模式的癌症分型方法,包括:获取目标癌症对象的scRNA‑seq数据并进行预处理;从预处理后的数据中获取线粒体功能相关基因集,评估每个细胞类群的线粒体功能活性状态,得到差异活性基因;获取目标癌症对象的RNA‑seq数据,确定每个癌症患者的线粒体功能活性评分;获取PCD机制相关基因表达数据,识别与线粒体功能活性评分相关的PCD基因;基于正常与肿瘤样本识别差异基因与差异活性基因以及PCD基因进行交集筛选,得到关键基因;从关键基因中筛选候选基因;将候选基因输入到综合机器学习模型中,得到细胞死亡特征;根据细胞死亡特征对目标癌症进行分型;本发明能够探索癌症中线粒体功能与PCD机制之间的联系。
技术关键词
线粒体功能 分型方法 综合机器 基因表达数据 CD机 富集分析方法 模式 对象 样本 患者 肿瘤 算法 广义 碱性 列表 效应 机制 网络
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