摘要
本发明公开了一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸鉴定方法。所述方法包括:获取待测样本的测序数据;利用宿主参考基因组数据库,对测序数据进行两次过滤,去除宿主序列;对过滤宿主后的测序数据进行物种分类,减少同源物种序列的干扰;利用鉴定物种参考基因组,进行序列的比对,获得准确的物种序列;将比对上的序列进行低复杂度序列的去除,减少序列偏好性的影响;利用BLAST对物种参考基因组进行二次比对或者比对到NT库上。应用本发明可以准确、特异的鉴定不同宿主样本的外源核酸序列,实现高宿主背景低外源物种生物量样本的有效分析。
技术关键词
序列鉴定方法
高通量测序技术
核酸
基因组测序数据
靶向测序数据
复杂度
样本
基因组分析
DNA序列
寄生虫
软件
算法
特异
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