一种fastq文件的测序数据拆分方法

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一种fastq文件的测序数据拆分方法
申请号:CN202411016841
申请日期:2024-07-29
公开号:CN118571316B
公开日期:2024-11-05
类型:发明专利
摘要
本说明书实施例公开了一种fastq文件的测序数据拆分方法。本说明书实施例的方法包括:接收并解析fastq文件,获得包含依次排序的barcode 1序列、W1序列、barcode 2序列、UMI序列、Poly T序列/TSO序列的read 1数据;依次从read 1数据中定位W1序列、barcode 2序列、UMI序列、Poly T序列/TSO序列在read 1数据中的位置信息和序列结构;获取read 1数据的前10bp序列为barcode 1序列的节选序列,进行白名单匹配;将barcode 2序列与白名单匹配,当上述两个序列均匹配成功时,该read 1数据为有效read 1数据。
技术关键词
序列 白名单 数据拆分方法 基因 汉明距离 总量 算法 平台 样本 依序 定义
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