预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法

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预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法
申请号:CN202411092630
申请日期:2024-08-09
公开号:CN119207588B
公开日期:2025-10-14
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种预测细胞类型特异性的增强子‑启动子相互作用的方法,它解决了预测细胞类型特异性相互作用等问题,其包括如下步骤:S1:数据下载;S2:数据预处理;S3:随机森林预测;S4:特征重要性分析;S5:评价指标;S6:细胞系内交叉验证;S7:细胞系间检验;S8:特征重要性排序。本发明具有细胞类型特异性预测效果好、适用性高等优点。
技术关键词
细胞系 增强子 启动子 样本 随机森林 数据 指数 节点 指标 代表 算法 聚类 定义 训练集 总量 血液 基因 曲线 人类 频率
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