一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法

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一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法
申请号:CN202411105076
申请日期:2024-08-13
公开号:CN118918944B
公开日期:2025-09-05
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其中方法包括:从公开数据库中,收集噬菌体多肽数据、收集抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;对抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据进行冗余序列去除后,分别与噬菌体多肽数据进行同源性分析,并进行预处理后,获取噬菌体特异性的抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;构建正样本数据集和负样本数据集;数据应用包括:训练神经网络,进行神经网络应用,获取噬菌体特异性抗细菌肽或非抗细菌肽数据正负样本分类预测。本发明方法有效的对噬菌体和抗细菌肽之间的协同作用进行探索,实现噬菌体特异性抗细菌肽/非噬菌体特异性抗细菌肽准确的目标分类,为后续噬菌体的工程改良及潜在高效抗细菌肽的发掘做出贡献。
技术关键词
噬菌体 数据 多肽 开放阅读框 训练神经网络 样本 嵌入特征 非天然氨基酸 冗余 预训练模型 重复序列 训练集 编码 字母 策略
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