摘要
本发明提供了一种基于卷积‑长短时记忆神经网络的育种方法,包括:对目标材料进行表型与基因型处理,得到训练数据集,包括基因型数据和表型数据;将训练数据集输入至卷积‑长短时记忆神经网络中进行训练和验证,得到训练好的预测模型;将待测数据输入至预测模型中,得到未知表型品种的育种值(或表型值);利用预测结果指导育种决策。本发明根据基因组数据含有噪声,具有位置效应且会因物种和测序方法产生较大差异的特性,提出了根据基因标记数量改变结构的卷积‑长短时记忆神经网络框架,及相应的噪声过滤和模型训练结果评价方法,构建一种有更好可解释性、符合遗传学规律、有普适性的深度学习育种方法,提高了育种效率。
技术关键词
基因
皮尔逊相关系数
数据
模型超参数
位点
神经网络框架
序列
滤波
窗口检测
测序方法
噪声
标记
评价方法
决策
地点
批量
效应
软件
数值
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