摘要
本发明涉及基于全基因组甲基化数据的肿瘤微环境评价方法和系统,包括,获取免疫细胞的全基因组甲基化测序数据,计算免疫细胞特征区域的区域甲基化比率;对所述区域甲基化比率进行富集分析,获取免疫细胞的富集分数,基于所述富集分数评估免疫细胞浸润状态。本发明的方案可应用于≤10X低深度全基因组甲基化数据,填补了基于低深度的全基因组甲基化技术平台评估肿瘤免疫微环境的空白。
技术关键词
免疫细胞
转录组测序数据
富集
肿瘤微环境
位点
比率
评价方法
肿瘤免疫微环境
基因
甲基化技术
肺癌
胞嘧啶
数据获取模块
评价系统
代表
芯片
平台
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检测芯片
基因型分型
玉米基因型
种质资源
玉米基因分型
骨科手术
特征提取网络
风险评估方法
数据
级联式
负压夹具
光学镜片
自动对准系统
边缘轮廓图
图像采集装置
全卷积神经网络
分辨率
编码器结构
混合块
解码器结构