一种基于拉曼光谱分选的单细胞组织原位测序技术

本发明涉及微生物单细胞测序技术领域，具体涉及一种基于拉曼光谱分选技术的单细胞组织原位测序方法。通过组织切片保留组织中微生物单细胞的位置信息，基于拉曼光谱对切片中组织的微生物单细胞进行识别，分选，获得所需的目标单细胞，不依赖于探针等进行标记，从而实现对单细胞组织水平的原位检测，并获得单细胞基因组和单细胞转录组信息。本发明所需的组织切片不需要经过酶穿透，消化，标记等步骤，在显微镜下直接观察到微生物形态，进行拉曼分选，操作简单；结合细胞形态与光谱比较，精确地分选到组织微生物单细胞，通过转录组分析报对物种进行鉴定，可以揭示宿主‑微生物互作过程中微生物单细胞水平基因转录变化。