通过单细胞Hi-C生成不同分辨率插补结果的方法和系统

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通过单细胞Hi-C生成不同分辨率插补结果的方法和系统
申请号:CN202411366869
申请日期:2024-09-29
公开号:CN118866122B
公开日期:2025-03-04
类型:发明专利
摘要
本申请实施例提供了通过单细胞Hi‑C生成不同分辨率插补结果的方法和系统,属于人工智能和生物信息学的技术领域。本发明获取若干个单细胞Hi‑C数据文件;对所述单细胞Hi‑C数据文件进行预处理,得到接触矩阵;对所述接触矩阵进行插补,得到插补接触矩阵;将所述插补接触矩阵进行求和操作,得到更新接触矩阵;根据所述更新接触矩阵,得到低分辨率插补信息。本发明解决了需要对原始的单细胞Hi‑C数据在不同分辨率下进行多次插补的问题,提高了对单细胞Hi‑C数据的插补效率,为下游分析提供了更为灵活的选择,在基因组学和转录组学等领域中具有广泛的应用前景,为探索基因组结构与功能的关系提供了强有力的工具。
技术关键词
矩阵 染色体 分辨率 位点 基因 计算机可执行指令 数据 可读存储介质 坐标 处理器 模块 存储器 聚类 指数 格式 算法 生物 关系
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