基于构象及力场的小分子过渡态初始结构生成方法及装置

基于构象及力场的小分子过渡态初始结构生成方法及装置，该方法根据输入分子中原子的键连接关系，通过分子结构生成策略，生成输入分子的初始构象并进行结构优化；对输入分子进行旋转平移，确定相对朝向，完成拼接结构的初始化；计算获得输入分子的转动惯量和总质量；计算获得若干输入分子的原子之间的相互作用力和拼接位点之间的相互作用力；将输入分子中每个原子受到的作用力，分解为穿过输入分子质心的力和力矩；计算获得输入分子的平动位移和转动位移，并更新输入分子中原子的坐标；通过迭代计算更新，输出若干输入分子拼接后的最终结构。本发明能够在拼接过程中能够有效避免原子重叠问题，并确保所选择的拼接位点保持在最短距离。