利用多种生物信息学方法在全基因组水平对杨树乳胶蛋白家族进行筛选鉴定和功能分析方法

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利用多种生物信息学方法在全基因组水平对杨树乳胶蛋白家族进行筛选鉴定和功能分析方法
申请号:CN202411559187
申请日期:2024-11-04
公开号:CN119479817A
公开日期:2025-02-18
类型:发明专利
摘要
利用多种生物信息学方法在全基因组水平对杨树乳胶蛋白家族进行筛选鉴定和功能分析方法,它涉及植物基因鉴定筛选领域,本发明将获取的杨树全基因组文件、注释信息文件、蛋白序列文件和MLP蛋白家族结构文件行初步筛选、重新建模、再次筛选,进行鉴定,得到最终的杨树MLP基因家族成员;利用在线理化性质分析软件,对理化性质进行预测分析,利用预测软件对基因结构、保守结构域、启动子区域顺式作用元件以及蛋白亚细胞定位进行可能的功能进行分析;利用进化树软件构建杨树MLP家族成员和拟南芥MLP家族成员的进化树,对二者的进化分析及分类进行分析。本发明可以有效快速的筛选得到感兴趣的杨树MLP家族基因,大大降低了分子手段筛选的时间和成本。
技术关键词
功能分析方法 生物信息学方法 家族 蛋白 基因 乳胶 软件 启动子 序列 构建系统 在线 元件 命令 感兴趣 共线 算法 分子
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