摘要
本发明涉及一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法及其应用。所述方法包括:进行组织透化处理,使用微球矩阵捕获芯片进行捕获,随后进行反转录和cDNA一链合成、cDNA二链合成,将微球矩阵捕获芯片进行分区,对每个区域解链以及cDNA扩增,对扩增产物进行纯化。本发明设计提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法,将芯片进行破碎分区或者使用杂交垫片设置分区进行检测,操作简单易行,并不需要直接提高条形码的种类,减少了扩大微球池时,合成微球引物的数量以及解码探针的种类,有效节省成本,另外也无需更多的解码轮次即可实现微球芯片的解码,能减少解码过程对捕获芯片的损伤,有效提高了大尺寸空间转录组芯片捕获的效率。
技术关键词
微球
转录组测序
捕获面积
芯片
矩阵
缓冲液
分区法
胃蛋白酶
文库
DNA聚合酶
磁珠
解码
捕获探针
垫片
组织切片
引物
染色
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