摘要
本发明涉及生物信息预测技术领域,提供一种基于深度学习框架的T细胞表位高通量筛选方法和装置,包括:根据输入的T细胞受体序列和抗原序列提取得到目标输入数据;其中,所述目标输入数据包括T细胞受体CDR3β序列和至少一个抗原表位肽段序列;将所述目标输入数据输入至预先构建的预测模型,得到预测结果;根据所述预测结果筛选得到筛选结果。本发明允许输入未经过规范化处理的T细胞受体序列和抗原序列,能够高效提取出其CDR3β序列,进而有效进行结合活性预测工作,通用性和稳定性提高的同时减少了操作者的数据预处理工作量,同时基于深度神经网络进行T细胞受体和表位结合概率的预测,有效地完成筛选工作。
技术关键词
高通量筛选方法
T细胞受体
序列
深度学习框架
相互作用特征
深度神经网络
二维卷积神经网络
特征提取器
信息预测技术
非暂态计算机可读存储介质
一维卷积神经网络
数据
隐马尔可夫模型
处理器
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样本
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