基于二代测序的腺相关病毒数据在多个参考基因组上的分类方法

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基于二代测序的腺相关病毒数据在多个参考基因组上的分类方法
申请号:CN202411738893
申请日期:2024-11-29
公开号:CN119649909A
公开日期:2025-03-18
类型:发明专利
摘要
本发明归属于生物信息学领域二代测序数据分析技术,尤其是涉及一种基于二代测序的腺相关病毒数据在多个参考基因组上的分类方法,包括如下步骤;S1、同源序列在基因组上的位置信息文件的构建;S2、原始BAM文件的建立;S3、比对信息汇总列表T的构建;S4、QNAME列表的构建;S5、过滤;S6、统计。本发明的方法首次通过短片段测序的方法,在计算机算法层面对AAV的主要成分进行鉴定和分析。相较于以实验为主的方法,本发明的分析结果具有更高的成分定量精确性和更低的人力操作成本。本发明的方法对AAV药物的临床检测具有重要的意义。
技术关键词
分类方法 列表 序列 病毒 二代测序数据分析 染色体 样本 表格 报告 逻辑 计算机 载体 算法 人力 药物 生物 密度
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