一种预测蛋白质-配体结合亲和力的方法和装置

本发明公开基于距离和原子接触数预测蛋白质‑配体结合亲和力的方法和装置，包括：获取蛋白质‑配体结合亲和力的数据集，其中，所述数据集包括：蛋白质受体的原子信息和配体的原子信息；按照预设的原子类型对所述数据集中蛋白质‑配体复合物的原子进行分类，并按照所述原子类型计算所述数据集中蛋白质‑配体的原子对的距离和原子接触数；将所述蛋白质‑配体的距离和原子接触数作为训练数据对预设模型进行训练得到蛋白质‑配体结合亲和力预测模型；获取待预测的蛋白质‑配体数据信息，并输入至所述蛋白质‑配体结合亲和力预测模型，输出所述待预测的蛋白质‑配体的结合亲和力。本发明不局限于传统的静电相互作用能、范德华相互作用能中距离的幂指数，提高了亲和力的预测能力。