用于病毒基因变异检测的多序列比对方法

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用于病毒基因变异检测的多序列比对方法
申请号:CN202411960406
申请日期:2024-12-30
公开号:CN119360964B
公开日期:2025-03-07
类型:发明专利
摘要
本申请涉及病毒基因变异检测技术领域,具体涉及用于病毒基因变异检测的多序列比对方法,该方法包括:采集待检测的病毒基因序列以及若干个病毒基因比对序列;基于初始预设的空位罚分,采用多序列比对算法获取病毒基因序列与任意一个病毒基因比对序列之间的初始得分矩阵;在对初始得分矩阵的回溯过程中,动态计算不同位置的空位罚分修正结果;基于病毒基因序列与任意一个病毒基因比对序列在回溯过程中不同位置的空位惩罚修正结果对初始得分矩阵进行修正,将修正结果代入到多序列比对算法中对病毒基因进行多序列比对。本申请旨在提高最终的比对结果的准确性。
技术关键词
序列比对方法 连续性 多序列比对算法 因子 变异检测技术 矩阵 阈值分割算法 基因 表达式 动态 元素 关系
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