摘要
本发明公开了一种基于机器学习的耐盐大豆全基因组选择方法,所述方法包括以下步骤:1)获取用于建模的数据集的基因型和盐处理后表型,并进行处理;2)对SNP位点和缺失样品进行严格质控;3)对所述有效变异位点进行全基因组关联分析,获得高质量变异位点;4)将所述训练集中的高质量变异位点数据导入CA注意力机制和多重残差模块的卷积神经网络建立模型;5)确定最优模型;6)获取待测盐胁迫表型的大豆群体的重测序数据,提取其高质量变异位点,利用最优模型进行盐胁迫表型预测。本发明能够有效预测大豆盐胁迫表型,降低田间选育成本,显著提高耐盐大豆育种效率。
技术关键词
全基因组关联分析
残差模块
位点
皮尔逊相关系数
大豆种质
混合线性模型
通道注意力机制
随机梯度下降
品种选育
数据分布
叶片
离子
样本
高层次
优化器
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PCR基因分型
注意力
构建系统
序列分析技术
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超声换能器模块
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变量
复合材料工艺
模型超参数
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稳定性提升方法
远程等离子源
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