基于机器学习的耐盐大豆全基因组选择方法、系统及应用

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基于机器学习的耐盐大豆全基因组选择方法、系统及应用
申请号:CN202411970185
申请日期:2024-12-30
公开号:CN119889448A
公开日期:2025-04-25
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于机器学习的耐盐大豆全基因组选择方法,所述方法包括以下步骤:1)获取用于建模的数据集的基因型和盐处理后表型,并进行处理;2)对SNP位点和缺失样品进行严格质控;3)对所述有效变异位点进行全基因组关联分析,获得高质量变异位点;4)将所述训练集中的高质量变异位点数据导入CA注意力机制和多重残差模块的卷积神经网络建立模型;5)确定最优模型;6)获取待测盐胁迫表型的大豆群体的重测序数据,提取其高质量变异位点,利用最优模型进行盐胁迫表型预测。本发明能够有效预测大豆盐胁迫表型,降低田间选育成本,显著提高耐盐大豆育种效率。
技术关键词
全基因组关联分析 残差模块 位点 皮尔逊相关系数 大豆种质 混合线性模型 通道注意力机制 随机梯度下降 品种选育 数据分布 叶片 离子 样本 高层次 优化器
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