基于图神经网络预测蛋白稳定性

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基于图神经网络预测蛋白稳定性
申请号:CN202480002537
申请日期:2024-07-19
公开号:CN119213497A
公开日期:2024-12-27
类型:发明专利
摘要
提供了基于图神经网络预测蛋白稳定性的方法。具体地说,提供了一种预测蛋白质突变后稳定性的方法,包括:基于待预测蛋白质样本序列信息,使用预训练模型进行特征提取,获得待预测蛋白质样本的序列特征;基于待预测蛋白质样本的三维结构信息,获得待预测蛋白质样本的结构特征;基于序列特征和结构特征,使用基于图神经网络的预测模型进行预测,确定待预测蛋白质样本突变后的稳定性预测结果。还提供了一种蛋白质突变后稳定性预测模型的构建方法。通过将自然语言处理模型与图神经网络相结合,预测发生突变导致的稳定性变化,表现出优于早期方法的性能。
技术关键词
序列特征 预训练模型 样本 蛋白质三维结构 训练集 非瞬时性计算机可读存储介质 阿尔法 网络结构 子模块 计算机系统 标签 存储计算机程序 分类器 坐标 位点 节点 电子设备
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