基于尺度不变特征变换和预过滤的同源蛋白质查找方法

本申请涉及生物信息学技术领域，特别涉及一种基于尺度不变特征变换和预过滤的同源蛋白质查找方法，其中，方法包括：获取待比对蛋白质结构中的‑碳原子坐标，计算其对应的距离矩阵，并利用SIFT算法提取距离矩阵的特征描述向量矩阵，将该矩阵映射至高维球面，并通过球面分区的预过滤算法从大规模蛋白质数据库中快速筛选出满足预过滤条件的候选蛋白质结构，将待比对蛋白质结构与候选蛋白质结构的特征描述向量矩阵进行GPU加速的精确比对，以生成蛋白质结构比对结果，进而确定待比对蛋白质对应的同源蛋白质。由此，本申请在保持比对精度的同时提升了比对速度，克服了现有技术中效率与精度难以兼顾的不足，适用于大规模蛋白质数据库的快速搜索与高效比对。