摘要
本发明涉及一种ESCC肿瘤细胞差异表达检测方法和系统,通过基于H3K27交流芯片,采用ChIP‑seq测序技术分别获取各个组织中转录组的H3K27ac信号,并上报至时间序列分析预测软件;时间序列分析预测软件根据H3K27ac信号,从热图上找到具有H3K27ac富集信号的差异增强子,并进一步从Nor、EC和LNC中具有H3K27ac富集信号的增强子中识别出对应的超级增强子(SEs)。能够预测出并找到抑制ESCC肿瘤细胞反应差异表达的超级增强子(SEs),通过SEs描述可以进一步描述抑制ESCC肿瘤细胞增殖的过程,为ESCC肿瘤细胞治疗提供基本研究和临床癌症治疗价值。
技术关键词
增强子
细胞差异表达
启动子
肿瘤
富集
测序技术
信号
软件
序列
组织
食管鳞状细胞癌
聚类分析算法
分布特征
基因
成分分析
样本
癌症治疗
数据
处理器
无监督
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