基于基因网络图表示的单细胞序列生成系统

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基于基因网络图表示的单细胞序列生成系统
申请号:CN202510049937
申请日期:2025-01-13
公开号:CN119964644A
公开日期:2025-05-09
类型:发明专利
摘要
一种基于基因网络图表示的单细胞序列生成系统,包括:序列‑图转换器、迭代模块、图‑序列转换器和迭代模块,其中:序列‑图转换器根据遗传和调控关系,将单细胞基因序列转换为单细胞基因网络图;迭代模块施加衰减约束并学习一跳参数,即单细胞基因网络图中边的参数,通过图扩散算法迭代推导得出多跳关系;图‑序列转换器分离单细胞基因网络图上所有节点向量并按照转换前序列中的基因顺序重排,得到单细胞基因序列。本发明基于基因网络图表示的单细胞基础模型的计算框架处理单细胞测序数据,通过使用基因网络知识优化和轻量化单细胞基础模型的表示,将各种单细胞基础模型整合为支柱,并提高其性能。
技术关键词
序列生成系统 基因 转换器 注意力 扩散算法 皮尔逊相关系数 关系网络图 特征数 节点 结构单元 矩阵 模式 模块 参数 基座 索引 框架 基础
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