摘要
本发明提供了融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法,通过将测序得到的植物转录因子结合位点区域的DNA序列数据进行One‑hot编码处理和DNA双螺旋的空间结构特征提取;利用ODConv网络动态提取不同类别TFBS序列的模式特征,利用卷积神经网络提取DNA空间结构特征;利用CubeMLP从序列、模态和通道三个维度实现DNA序列特征模态和DNA空间结构模态特征的高效融合;利用全连接层和Sigmoid函数将融合特征的结果映射为不同类别的转录因子结合位点,进而实现不同类别转录因子绑定位点的识别;实现了预测转录因子结合位点的功能。本发明预测准确率高,为植物的转录因子的识别位点研究了提供新参考,具有广泛的应用前景。
技术关键词
位点预测方法
转录因子
DNA序列特征
动态卷积网络
蒙特卡洛模拟方法
编码
多层感知机
融合特征
空间结构特征提取
矩阵
模态特征
卷积神经网络提取
注意力机制
系统为您推荐了相关专利信息
仿真模拟方法
联合损失函数
生成高质量图像
序列
深度确定性策略梯度
充电负荷模型
优化设计方法
鲁棒优化模型
容量规划
容量优化模型
不确定性模型
分布鲁棒优化
光储电站
多时间尺度
功率
深度确定性策略梯度
风场
风力发电场
动态时间规整算法
指令执行效率