摘要
本发明涉及生物技术领域,提供一种用于AML诊断的易感SNP位点靶标基因的筛选方法及其应用,方法包括:获取AML易感SNP位点、三维基因组数据以及AML病人队列数据;对三维基因组数据进行预处理,获得DNA相互作用区段;根据DNA相互作用区段预测AML易感SNP位点调控的潜在靶标基因;根据AML易感SNP位点调控的潜在靶标基因,筛选高可信度的转录调控靶标基因,获得高可信度的靶标基因集;运用体外细胞实验验证高可信度的靶标基因集的SNP的转录调控活性。本发明拓展了对于AML易感SNP与靶标基因之间调控网络的理解,提供了新的生物标志物和药物靶点。
技术关键词
靶标
位点
筛选方法
线性回归模型
突变等位基因
转录调控活性
数据
队列
因子
染色体
生物标志物
成分分析
细胞系
启动子
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