摘要
本发明公开了一种基于宏基因组的急性重症肺炎患者重症及死亡风险预警模型的构建方法,包括如下步骤:(1)提取样本DNA;(2)DNA文库的构建及测序;(3)测序结果预处理;(4)基因比对;(5)物种注释;(6)使用R软件统计各个样本细菌届的物种组成,将原始reads数转换成细菌届的相对丰度值,使用R包vegan计算样本细菌种水平的物种多样性的香农指数。本发明利用宏基因组鉴定下呼吸道微生物组的sS I,可以有效地识别急性重症患者100天的死亡风险,有助于临床早期识别高死亡风险人群,辅助制定治疗方案,改善临床患者预后。
技术关键词
预警模型
患者
风险
宏基因组鉴定
文库构建试剂盒
指数
样本
超声波破碎
测序接头
测序平台
分析系统
匹配模块
目录
输出模块
序列
可读存储介质
呼吸道
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