一种基于三代测序技术对CRISPR-cas9的基因编辑效率以及基因编辑连锁现象的快速检测方法

本发明公开了一种基于三代测序技术对CRISPR‑Cas9基因编辑效率及连锁现象的快速检测方法。该方法包括序列前处理与突变检测、测序错误纠错模型构建、基于模型纠正错误位点和基因编辑突变连锁分析四个步骤。通过获取FASTQ格式的三代测序数据，清洗数据并识别突变类型；构建朴素贝叶斯模型对测序错误进行纠错，提高数据准确性；利用纠错模型对突变进行分类并恢复假阳性突变；最后进行单靶点或多靶点的基因编辑突变连锁分析。本发明首次将三代测序技术应用于基因编辑效率和靶位点突变的检测，提高了检测效率和准确性，显著降低了测序错误率，为基因编辑领域提供了一种全新的、高效的检测手段，尤其在基础研究、基因治疗及遗传改良等领域具有重要应用价值。