摘要
本发明公开了一种基于深度学习的siRNA序列设计方法及活性预测装置,涉及人工智能辅助生物技术领域。方法包括对靶点mRNA进行全局扫描,按照预定步长和预定窗口宽度将靶点mRNA截取为RNA序列片段,枚举所有可用的候选siRNA序列片段;过滤掉候选siRNA序列片段中GC含量在预定范围外的序列片段,并排除转录组中出现频率大于预设阈值的15聚体序列;将上述siRNA序列数据、mRNA序列及结构数据和实验信息输入至深度学习模型,输出活性预测值,对活性排序靠前的siRNA序列进行分析,输出潜在的siRNA序列。本发明能够更准确地预测真实的实验场景中siRNA的活性,并进行siRNA序列的高效设计。
技术关键词
归一化模块
序列特征
结构特征提取
序列设计方法
卷积模块
预测装置
输出模块
输入端
深度学习网络
压缩特征向量
残差模块
注意力
输出端
深度学习模型
变量
积层
人工智能辅助
输入模块
系统为您推荐了相关专利信息
多维度特征提取
检索图像
图像检索方法
图像特征向量
局部特征描述子
印刷电路板缺陷
金字塔结构
检测印刷电路板
语义
融合特征
深度卷积神经网络
混合网络模型
脉冲神经网络模型
故障诊断方法
线性单元
电力系统信息安全
时间序列特征
物理
传输方法
指纹
吹瓶机烘箱
数字孪生系统
无线收发模块
数据采集模块
自动控制系统