基于深度学习的siRNA序列设计方法及活性预测装置

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基于深度学习的siRNA序列设计方法及活性预测装置
申请号:CN202510244458
申请日期:2025-03-03
公开号:CN120148613B
公开日期:2025-11-25
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于深度学习的siRNA序列设计方法及活性预测装置,涉及人工智能辅助生物技术领域。方法包括对靶点mRNA进行全局扫描,按照预定步长和预定窗口宽度将靶点mRNA截取为RNA序列片段,枚举所有可用的候选siRNA序列片段;过滤掉候选siRNA序列片段中GC含量在预定范围外的序列片段,并排除转录组中出现频率大于预设阈值的15聚体序列;将上述siRNA序列数据、mRNA序列及结构数据和实验信息输入至深度学习模型,输出活性预测值,对活性排序靠前的siRNA序列进行分析,输出潜在的siRNA序列。本发明能够更准确地预测真实的实验场景中siRNA的活性,并进行siRNA序列的高效设计。
技术关键词
归一化模块 序列特征 结构特征提取 序列设计方法 卷积模块 预测装置 输出模块 输入端 深度学习网络 压缩特征向量 残差模块 注意力 输出端 深度学习模型 变量 积层 人工智能辅助 输入模块
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