摘要
本发明公开了一种基于联合Q学习优化元路径的药物靶标相互作用预测方法,先整合来自不同来源的生物相互作用数据,构建异质信息网络,并学习药物结构特征和蛋白质序列特征;然后使用联合Q学习算法进行元路径的联合优化,得到最优元路径集合;接着节点表示学习,包括构建元路径子图、采用高阶图卷积神经网络和改进的Vanilla图卷积神经网络处理不同深度的元路径子图,通过注意力机制融合不同元路径学到的节点表示特征;最后将节点特征中的药物特征与靶标特征进行拼接,送入全连接神经网络计算相互作用概率,形成最终的药物靶标相互作用预测模型并用于预测。本发明充分利用节点信息,显著提升子图表示能力,提升方法的适应性和效率。
技术关键词
异质信息网络
药物
靶标相互作用
序列特征
Q学习算法
紧凑特征
特征抽取方法
节点特征
注意力机制
多层感知机
疾病
超参数
样本
矩阵
定义
生物
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基因表达谱
细胞系
深度神经网络模型
训练深度神经网络
皮尔逊相关系数
分子结构特征
关联关系预测方法
序列特征
基因
中草药