摘要
一种疾病标志物的蛋白质相互作用网络建立方法,属于疾病标志物领域,包括:收集样本并提取总蛋白,进行蛋白质定量测定;利用磁珠偶联的特异性抗体进行亲和层析富集目标疾病标志物蛋白质;采用液相色谱质谱联用技术进行组分鉴定;测定蛋白质组分的表达丰度;采用实时荧光共聚焦显微镜进行动态成像;计算相互作用强度矩阵并构建初始网络拓扑结构;构建并求解综合考虑蛋白质空间位阻效应、表达丰度相关性、共定位系数及相互作用强度的网络优化方程组;采用最小支配集算法识别关键蛋白质节点;构建组织特异性的疾病标志物蛋白质相互作用网络;本发明针对如何构建组织特异性的疾病标志物蛋白质相互作用网络这一核心技术问题进行了创新性研究。
技术关键词
液相色谱质谱联用技术
标志物
识别关键蛋白质
网络拓扑结构
网络优化
空间位阻效应
节点
集算法
矩阵
蛋白质定量方法
蛋白质表达
疾病
初始相互作用
方程
显微镜
荧光
磁珠
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