一种基于杂交热力学和动力学的通用核酸探针设计方法

本发明公开了一种基于杂交热力学和动力学的通用核酸探针设计方法，包含以下步骤：1)依据片段区间确定目标扩增区域，产生满足长度要求且覆盖目标片段的引物对，采用智能核酸杂交算法计算核酸杂交的吉布斯自由能变化，结合化学热力学、动力学参数、序列互补性以及酶促反应的特性，在多维约束条件下生成最优引物对；2)在生成的最优引物对基础上，生成满足自由能差异阈值的探针组合为候选池，通过迭代流程从候选池中筛选目标函数值最高的探针组合，逐步更新候选池，直到输出目标函数值最高的引物对和探针组合。本发明通过引入智能算法，结合热力学模型、动力学模型和特异性评估，自动生成最优的引物和探针组合，确保设计的稳定性和可靠性。