摘要
本发明属于计算生物学和蛋白质工程领域,公开了一种跨种通用型副黏病毒RdRp的设计方法及系统,该设计体系融合序列、蛋白质语言表征和结构等多层次信息,通过多模态、多模型协同策略挖掘具备跨种功能的RdRp候选序列,主要包括:候选挖掘阶段、初步设计与湿实验验证、结构优化阶段,本发明利用BLAST等方法进行序列相似度分析,结合ESMC等蛋白语言模型提取蛋白序列的深层表征,再辅以Alphafold3进行三维结构预测,综合多维度相似度指标筛选出具有潜在跨种通用性功能的RdRp候选分子,初步设计后,借助RFdiffusion等蛋白质生成模型进行结构修正与优化,重点提升其分子稳定性、通用性及目标结合能力。
技术关键词
通用型
序列
病毒
功能区域识别
冗余
蛋白
多模型协同
三维结构
综合性
数据
设计系统
模板
位点
分析方法
分子
多层次
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多模态
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