基于Transformer的多肽与MHC-I分子结合预测方法

本发明公开了一种基于深度学习Transformer架构预测多肽与MHC‑I型分子之间结合关系的方法，包括：将MHC序列使用伪序列的方式进行编码，然后通过一个嵌入表示层将MHC伪序列与多肽序列的每个氨基酸表示为一个密集的向量，并加入位置信息；融合模块将特征进行融合，得到综合的特征表示；编码模块采用Transformer的编码器(Encoder)结构，经过多个编码器对融合特征进行充分的学习；映射模块对融合后的特征进行处理，输出多肽与MHC分子结合的概率。该方法能够快速较准确地预测多肽与MHC‑I分子之间结合关系。