摘要
本发明属于单细胞RNA测序技术领域,提供了一种单细胞RNA测序数据细胞注释方法,包括以下步骤:S1、整合现有工具的标记基因库,补充Th2、Th9、Th22稀有亚群及功能状态的特异性标记基因;S2、支持用户自定义标记基因集;S3、引入可变剪切和基因本体分析,结合转录本结构变化和通路富集结果;S4、引入异常值检测算法,识别病理状态下的异常表达细胞;S5、结合聚类、参考比对和机器学习三种策略,输出一致性注释结果;本发明通过整合并补充稀有亚群及肿瘤微环境相关细胞的特异性标记基因库,支持用户自定义标记基因集,引入可变剪切和基因本体分析等技术手段,有效提高了细胞注释的准确性和全面性。
技术关键词
注释方法
支持用户自定义
标记基因
识别病理
肿瘤微环境
单细胞分析
数据
修剪功能
多线程并行计算
DBSCAN算法
模糊匹配算法
注释系统
聚类
可视化界面
深度学习模型
文件格
策略
测序技术
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初始聚类中心
荧光
肿瘤微环境
超像素分割算法
模块
肿瘤微环境响应
光动力
有机分子荧光探针
肿瘤微环境变化
硅胶柱层析
页面配置文件
多模态交互
消息
封装模块
识别算法
细胞粘附多肽
点击化学反应
螺旋
药物对肿瘤细胞
MMP抑制剂
数据统计系统
数据分析模块
数据采集模块
自定义可视化
支持用户自定义