一种单细胞RNA测序数据细胞注释方法

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一种单细胞RNA测序数据细胞注释方法
申请号:CN202510508493
申请日期:2025-04-22
公开号:CN120412760A
公开日期:2025-08-01
类型:发明专利
摘要
本发明属于单细胞RNA测序技术领域,提供了一种单细胞RNA测序数据细胞注释方法,包括以下步骤:S1、整合现有工具的标记基因库,补充Th2、Th9、Th22稀有亚群及功能状态的特异性标记基因;S2、支持用户自定义标记基因集;S3、引入可变剪切和基因本体分析,结合转录本结构变化和通路富集结果;S4、引入异常值检测算法,识别病理状态下的异常表达细胞;S5、结合聚类、参考比对和机器学习三种策略,输出一致性注释结果;本发明通过整合并补充稀有亚群及肿瘤微环境相关细胞的特异性标记基因库,支持用户自定义标记基因集,引入可变剪切和基因本体分析等技术手段,有效提高了细胞注释的准确性和全面性。
技术关键词
注释方法 支持用户自定义 标记基因 识别病理 肿瘤微环境 单细胞分析 数据 修剪功能 多线程并行计算 DBSCAN算法 模糊匹配算法 注释系统 聚类 可视化界面 深度学习模型 文件格 策略 测序技术
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