基于GCN和对比学习的lncRNA–miRNA关联预测系统及方法

基于GCN和对比学习的lncRNA–miRNA关联预测系统及方法，属于生物信息技术领域。为了解决现有lncRNA–miRNA关联预测方法存在节点表示能力有限的问题。本发明基于所有lncRNA和miRNA序列分别生成k‑mer计数向量，并对k‑mer序列进一步引入Doc2Vec模型获得序列语义特征，进而基于计数向量和序列语义特征得到联合特征向量；基于lncRNA和miRNA异质图以及联合特征向量得到图中节点的初始表示，然后使用节点级注意力机制进行邻居节点信息聚合，并使用层级注意力机制进行信息聚合，得到lncRNA和miRNA的最终节点特征，进行加权融合得到LMI特征，进而预测得到预测得分。