摘要
本发明公开了芽囊原虫亚型感染诊断与载量预测的肠道微生物标志物及其应用。通过对芽囊原虫感染者粪便中微生物组分进行宏基因组测序,获得微生物的丰度,通过筛选运算找到22个特定菌种作为标志物,构建芽囊原虫亚型感染风险预测模型,预测灵敏度高、特异性好,准确度在90%以上。检测该标志物丰度的检测产品可以用于检测芽囊原虫感染亚型。进一步地,本发明通过对含有前述标志物的芽囊原虫阳性个体粪便中微生物组分进行宏基因组测序,筛选出32种与芽囊原虫载虫量显著相关的微生物,检测该肠道微生物标志物丰度的相关检测产品可以用于芽囊原虫感染载量预测,从而为芽囊原虫亚型的流行病学研究和临床诊断提供可靠的检测工具。
技术关键词
肠道微生物标志物
随机森林模型
筛选方法
风险预测模型
交叉验证方法
交叉验证法
错误率
分类器
检测工具
扩增子
菌种
计算方法
变量
特异
引物
参数
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