摘要
本发明涉及一种基于度量学习的系统发生树构建方法。它解决了现有技术中系统发生树构建计算复杂度高且效率低下,准确度不佳的问题。它包括S1、收集包含核酸序列及对应已构建进化树的公开数据集;S2、对收集的数据集进行特征提取;S3、设计并构建度量学习模型,优化数据点之间的相似性度量;S4、使用训练集对度量学习模型进行训练并生成相似性矩阵;S5、基于生成的相似性矩阵,使用系统发生树构建算法构建树形结构并进行结果验证;S6、应用分析。本发明的优点在于:克服了传统方法中距离测量精度低、模型假设局限性强、计算复杂度高等问题,实现了大规模生物数据下系统发生树的高效构建。
技术关键词
树构建方法
度量
三元组损失函数
构建算法
可视化工具
矩阵
样本
交叉验证方法
树形结构
超参数
核酸序列数据
分支
校正方法
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