基于交互表示的柔性流形空间生成分子对接方法及装置

本发明提供一种基于交互表示的柔性流形空间生成分子对接方法及装置，其中的方法包括：根据采样状态，获取蛋白质坐标和小分子坐标；基于预训练的交互表示学习模型，根据带噪声的蛋白质口袋和带噪声的配体小分子，生成蛋白质‑分子交互表示；基于预先训练的生成模型，根据蛋白质坐标、小分子坐标以及蛋白质‑分子交互表示，生成去噪后状态；根据去噪后状态，得到蛋白质口袋和配体小分子的结合构象。该方法通过将蕴含有蛋白质和小分子之间原子级距离信息的交互表示作为配体小分子的平移旋转二面角和蛋白质口袋侧链的二面角的生成条件，在柔性流形空间上生成配体小分子和蛋白质口袋侧链的构象变化，实现了蛋白质口袋与配体小分子的快速、精确对接。