摘要
本发明属于生物检测技术领域,公开了基于宏转录组学的呼吸道感染相关生物标志物的筛选方法。本发明将具有不同临床表型的呼吸道感染样本进行宏转录组测序,数据质控、比对,转录本定量,保留病原体及宿主信息,随后结合差异表达分析和共表达分析鉴定出在不同分组中稳定表达或显著变化的基因,得到潜在生物标志物,取LASSO算法、随机森林模型和SVM模型三种机器学习算法的交集基因,得到所述生物标志物。本发明为呼吸道感染的快速、准确鉴定提供一种生物标志物的筛选方法。
技术关键词
筛选方法
宏转录组
差异表达分析
差异表达基因
潜在生物标志物
机器学习算法
随机森林模型
呼吸道
基因共表达网络
支气管肺泡灌洗液
生物检测技术
数据
模块
样本
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