基于RNA-DNA和DNA-DNA互作信息的染色质互作信息增强方法

本发明提供一种基于RNA‑DNA和DNA‑DNA互作信息的染色质互作信息增强方法，涉及生物信息学技术领域。所述方法包括：收集RNA‑DNA互作的iMARGI数据和DNA‑DNA互作的原始Hi‑C数据；对iMARGI数据进行特征提取后进行皮尔逊相关系数计算，得到融合RNA信息的DNA‑DNA特征相关系数矩阵；对原始Hi‑C数据下采样后进行FAN完整化处理，得到完整化的Hi‑C矩阵；构建CNN网络模型，以上述两部分为输入，对模型进行训练，模型的输出为增强后的Hi‑C矩阵；对于训练好的模型，输入不同RNA类型的数据，预测得到相应的Hi‑C矩阵，用于下游分析。本发明能够整合RNA互作数据与Hi‑C数据，实现多模态数据整合与分析，推动RNA与染色质相互作用研究的进一步发展。