摘要
本发明涉及液相芯片领域,公开了一种山茶花全基因组液相芯片的构建方法及其应用,构建方法包括以下步骤:采集山茶花样品,采用磁珠介导的CTAB法从新鲜叶片制备高质量基因组DNA,所述DNA满足1.8<OD260/280<2.0且OD260/230>2.0;将基因组DNA片段化为200‑300bp的片段,经末端修复、连接接头和Pre‑PCR扩增构建文库;使探针与目标区域杂交。通过对多种山茶花样品经高质量基因组DNA制备、文库构建、探针杂交捕获、高通量测序及严格的数据过滤与分析等一系列流程构建液相芯片,全面覆盖山茶花基因组信息,能够系统且完整地获取山茶花基因组相关数据。
技术关键词
山茶花
液相
芯片
主成分聚类分析
全基因组关联分析
混合线性模型
高通量测序平台
遗传连锁图谱
探针
原始图像数据
文库
磁珠
效应
叶片
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