一种基于多重隐藏参考序列的DNA存储读出方法

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一种基于多重隐藏参考序列的DNA存储读出方法
申请号:CN202510692750
申请日期:2025-05-27
公开号:CN120596016A
公开日期:2025-09-05
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于多重隐藏参考序列的DNA存储读出方法,该方法构建多重隐藏参考序列,实现从含有插入/删节错误的读段中可靠恢复大片段DNA;所构建的隐藏参考序列将大片段DNA存储中的从头读出转变为低复杂度的重测序问题;其中,水印参考序列快速识别低错误读段,骨架参考序列识别含有插入/删节错误的读段,译码反馈参考序列识别用于填充低覆盖区域的读段;逐读段的前向‑后向算法分阶段纠正插入/删节错误,实现可靠的数据恢复。本发明从含有插入/删节错误的读段中实现可靠的数据读出,其优势在于构建的多重隐藏参考序列分阶段识别错误率具有互补特点的读段,逐读段的前向‑后向算法分阶段纠正插入/删节错误,实现渐进式读出。
技术关键词
读出方法 符号 隐马尔可夫模型 水印 软判决译码 序列识别 分阶段 迭代译码器 标记 度量 滑动窗口 判决算法 码字 噪声 编辑 错误率
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