摘要
一种基于稀疏变分自编码器的微生物‑疾病关联预测系统,涉及涉及生物信息学及电子数据处理领域。本发明是为了解决现有微生物‑疾病关联预测方法还存在疾病‑微生物关联预测精度低的问题。本发明包括:获取已知微生物‑疾病关联矩阵;利用微生物‑疾病关联矩阵获取最终嵌入特征矩阵,并利用最终嵌入特征矩阵获取待测最终嵌入特征;将待测最终嵌入特征输入到训练好的CatBoost单元中,获得待预测疾病和微生物的关联关系预测值。本发明在训练阶段设计了PGVAEMDA模型,PGVAEMDA模型根据疾病和微生物的线性特征、非线性特征最终获取最终嵌入特征矩阵。本发明用于微生物和疾病关联关系的预测。
技术关键词
嵌入特征
矩阵
非线性特征提取
预测系统
疾病关联关系
编码器
特征提取单元
中间层
疾病关联预测方法
解码器
决策树模型
样本
模块
训练集
重构
元素
序列
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