摘要
本发明公开了一种利用多源信息预测环状RNA‑疾病潜在关联的方法。该方法基于多视图图卷积神经网络(GCN)与有偏随机游走算法node2vec构建深度学习框架。具体地,该方法首先整合疾病语义信息、环状RNA功能信息以及多种相似度指标,构建多视角的疾病与环状RNA相似度图。随后,采用多通道GCN模块提取局部图结构中的节点嵌入,并通过PCA算法降维提取共性特征。接着,该方法构建了融合相似度与已知关联关系的异构图,利用node2vec进行有偏随机游走,实现全局特征嵌入。最终,通过双线性解码器联合编码信息,输出环状RNA与疾病间的潜在关联评分。该方法有效融合局部结构信息与全局拓扑信息,显著提高了预测性能,适用于识别潜在的circRNA与疾病之间的关联。该方法在四个公开数据集上的实验结果显著优于现有技术,具备高准确率、强鲁棒性及良好的泛化能力,适用于疾病机制研究与靶点筛选等生命医学领域。
技术关键词
疾病机制研究
双线性
多源特征融合
环状
融合深度学习
异构
深度学习框架
多视角
PCA算法
强鲁棒性
多通道
冗余特征
嵌入特征
解码器
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