一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用

本发明涉及分子生物学实验技术领域，尤其涉及一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用。本发明提供了一种植物细胞器RNA末端的分析方法，包括如下步骤：对RNA进行5′多聚磷酸酶处理、体外环化，然后进行双端测序，过滤，得到清洁读长；MeCi算法对鉴定清洁读长进行鉴定；根据鉴定结果以及清洁读长数量判断RNA 5′和3′末端位置、末端类型、mRNA和ncRNA的末端位置以及mRNA和ncRNA的5′末端类型。该方法不仅分析细胞器RNA末端修饰以及细胞器RNApoly(A)长度和来源，还可以用于筛选参与植物细胞器RNA末端加工和稳定的RNase和RBP的底物RNA。