一种基于大语言模型的转录组注释方法及系统

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一种基于大语言模型的转录组注释方法及系统
申请号:CN202510817866
申请日期:2025-06-18
公开号:CN120356514B
公开日期:2025-09-16
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物信息学与计算生物学交叉领域,揭露了一种基于大语言模型的转录组注释方法及系统,包括:将单细胞空间坐标与基因表达值融合为伪图像模态数据,提取伪图像模态数据的空间拓扑特征;将空间拓扑特征与预设的医疗数据库之间进行跨模态对齐,分析跨模态嵌入向量的细胞类型概率;构建功能描述文本的功能语义空间,将非模式物种投影至功能语义空间中;计算基因表达嵌入与参考物种的同源基因之间的语义相似度,利用大语言模型将基因表达嵌入转换为语义映射关系。本发明通过减少单细胞空间转录组注释中面临空间拓扑建模粗放、跨模态对齐精度低、非模式物种注释受限及语义映射僵化等核心问题。
技术关键词
大语言模型 注释方法 拓扑特征 基因 跨模态 像素点 坐标 文本 图像 语义向量 样本 节点 注释系统 图谱 关系 数据 键值 持久性 模式
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